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Glycoreconnaissance : interactions sucres-protéines

Nos prestations en glycoreconnaissance associent des compétences en chimie et en biologie. Elles couvrent un large spectre d’expertises : production de protéines de reconnaissance (lectines et glycosidases), modélisation moléculaire et mesure des interactions moléculaires (constantes d’affinités ou d’inhibition).

 

Nos prestations d’ingénierie et de R&D

Nos experts accompagnent les biotech dans la conception de lectines artificielles et d’inhibiteurs dérivés de sucres pour des applications en santé : diagnostic, anti-infectieux, anti-cancéreux.

Modélisation des interactions moléculaires

Simuler le comportement de molécules et comprendre les interactions entre les molécules afin d’optimiser leur fonctionnement.

  • Drug design
  • Docking, dynamique moléculaire
  • Criblage virtuel
  • Structurale (moléculaire et protéique)

Production de lectines/glycosidases

Synthétiser des protéines fonctionnelles et améliorer leurs interactions avec des saccharides.

  • Production de protéines recombinantes
  • Troncature : production de fragments ou de domaines de protéines
  • Mutagenèse
  • Incorporation acides aminés non naturels
  • Analyse de l’intégrité structurale
  • Analyse de la stabilité

Mesures d’affinité moléculaire

Maîtriser l’interaction entre un ligand et son récepteur.

  • Criblage de chimiothèque
  • Mesure d’activités et d’inhibitions
  • Mesures IC50, Ki (inhibition d’interactions)
  • Microcalorimétrie Isothermale, Résonance Plasmonique de Surface, FRET
  • Polarisation de fluorescence
  • Technologie alpha, label free

Mesure de l’activité enzymatique

Identifier et analyser les mécanismes de réactions biochimiques, catalysées par une enzyme et étudier les évolutions sur une durée définie et un environnement spécifique.

  • Détermination des constantes cinétiques
  • Caractérisation de spécificité de substrat
  • Criblage d’activité enzymatique : lipases, glycoside hydrolases, sulfatases, sulfotransférases, monooxygénases
  • Etudes de stabilité enzyme/ réactivité (température, pH…)

L’appui des laboratoires de recherche

Pour mener à bien vos projets d’innovation, nos équipes bénéficient de l’appui et des moyens techniques des laboratoires de l’Université de Nantes.

Ingénierie moléculaire et glycobiologie

Cyrille GRANDJEAN

Directeur de recherche au CNRS, C. Grandjean est spécialisé dans la thématique de recherche ‘Sucres et reconnaissance moléculaire’ : développement de glycovaccins et interactions sucre/lectines pour la conception de ligands mono et multivalents.

 

Lauréat du Prix Servier d’Encouragement à la Recherche Thérapeutique en 2001, il a été responsable du laboratoire de synthèse au sein d’une start-up spécialisée dans le développement de kits de sérodiagnostic et de vaccins synthétiques, avant de rejoindre l’Institut Pasteur puis le CNRS en 2007

 

Il est co-inventeur d’un vaccin glycoconjugué actif contre la dysenterie bacillaire actuellement en étude clinique de phase II.

 

Brevets et publications

C. Grandjean compte 52 publications dans les journaux internationaux et est co-inventeur de 7 brevets.

En savoir plus

L’unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies (US2B)

L’US2B (UMR CNRS 6286) est un laboratoire académique développant des recherches fondamentales en biochimie (in-vitro, in-vivo et in-silico)et biologie (microalgue-bactéries, plante-bactéries, plante-plante, etc.).

Equipe de recherche : Ingénierie Moléculaire et Glycobiologie

Les principaux champs disciplinaires de l’équipe sont : la glyco-enzymologie, la glycotechnologie de la reconnaissance : conception de lectines artificielles (dérivés de sucres) pour des applications en santé (diagnostic, anti-infectieux, anti-cancéreux), la glyco-technologie vaccinale.

 

Publications scientifiques de référence :

  • Biophysical and structural characterization of mono/di-arylated lactosamine derivatives interaction with human galectin-3. Atmanene, C.; Ronin, C.; Gautier, F.-M.; Djedaïni-Pilard, F.; Téletchéa, S., Ciesielski, F.; Vivat, V.; Grandjean, C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2017, 489, 281-286
  •  Development of a sensitive microarray platform for the ranking of galectin inhibitors: identification of a selective galectin-3 inhibitor. Dion, J.; Advedissian, T.; Storozhylova, N.; Dahbi, S.; Lambert, A.; Deshayes, F.; Viguier, M.; Tellier, C.; Poirier, F.; Téletchéa, S.; Dussouy, C.; Tateno, H.; Hirabayashi, J.; Grandjean, C. Chembiochem 2017, 18, 2428-2440.

Glycochimie et bioconjugués

Sébastien GOUIN

S. Gouin est Directeur de recherche au CNRS et Responsable de l’équipe de recherche CORAIL

Les travaux de recherche de S. Gouin se situent à l’interface chimie-biologie avec une spécialité dans la glycochimie et la bioconjugaison (synthèse d’inhibiteurs glycosidiques, greffage de sucres sur des biomolécules).

Son intérêt pour l’interdisciplinarité l’a amené à collaborer avec plusieurs laboratoires nationaux et internationaux sur des thématiques de recherche complémentaires.

 

Brevets et publications

Co-inventeur principal de 5 brevets de familles de molécules.

Co-auteur de 72 publications scientifiques internationales à comité de lecture dont 35 articles en auteur correspondant.

25 Invitations en conférences dans des universités ou des congrès, dont 9 à l’international.

Referee pour des revues internationales à comité de lecture (environ 10/ an) dans des journaux spécialisés comme (J. Am. Chem. Soc, Org. Biomol. Chem. ; J. Med. Chem. ; Chem. Eur. J; Chemical Sciences, Bioorg. Med. Chem. RSC Advances….)

 

En savoir plus

Laboratoire en Chimie Moléculaire de Nantes CEISAM

Les thématiques de recherche du laboratoire sont : la synthèse de molécules organiques et de matériaux hybrides, les développements méthodologiques en chimie analytique et la modélisation moléculaire.

Équipe de recherche CORAIL

L’équipe CORAIL focalise sa recherche sur le développement de glyco-conjugués thérapeutiques (modulateurs mono et multivalents de lectines et de glycosidases), de virus fonctionnalisés par des sucres pour la thérapie génique et de radio-conjugués.

Publications scientifiques de référence :

  • Polyvalent Transition-State Analogues of Sialyl Substrates Strongly Inhibit Bacterial Sialidases. Assailly, C.; Bridot, C.; Saumonneau, A.; Lottin, P.; Roubinet, B.; Krammer, E-M.; François, F.; Vena, F.; Landemarre, L.; Alvarez Dorta, D.; Deniaud, D.; Grandjean, C.; Tellier, C.; Pascual, S.; Montembault, V.; Fontaine, L.; Daligault, F.; Bouckaert, J.; Gouin, S.G. Eur. J. 2021, 27, 3142-3150.
  • Electrochemically promoted tyrosine-click-chemistry for protein labelling. Avarez-Dorta, D. ; Thobie, C.; Croyal, M.; Bouzelha, M.; Mével, M.; Deniaud, D. ; Boujtita, M. ; Gouin, S.G. Amer. Chem. Soc., 2018, 140, 17120-17126.

Développement de biocapteurs

Notre parc de moyens d’essai et de mesure

Plus de 150 équipements dédiés

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