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Production de
protéines recombinantes

Les protéines recombinantes sont des protéines produites dans des cellules modifiées par génie génétique. Il est possible d’obtenir des protéines en très grande quantité et avec un degré de pureté élevé, notamment à des fins thérapeutiques.
A l’aide de méthodes de mutagenèse et d’évolution dirigée, nos ingénieurs R&D interviennent dans l’évaluation de la faisabilité de l’expression d’une protéine recombinante, la modification du site catalytique enzymatique (in silico et in vitro), la création de banques de clones d’enzymes et la production à façon.

Nos prestations d’ingénierie et de R&D

Nos prestations et projets R&D s’étendent à la synthèse de peptides, la production des protéines en fermenteur batch en système procaryote (bactéries) ou eucaryotes (insectes, levures), purification d’enzymes, identification/évaluation d’activité.

Clonage moléculaire : synthèse des vecteurs d’expression plasmidique

Construire des systèmes biologiques artificiels pour l’ingénierie moléculaire à l’aide du clonage et de l’optimisation de l’expression génique.

  • Clonage moléculaire et sous clonage de vecteurs
  • Conception à façon de vecteurs d’expression souches-dépendants : promoteur adapté à l’hôte, gène de sélection, insertion d’étiquettes (tags)
  • Étude de l’adaptation des souches aux conditions de culture
  • Optimisation des conditions de production des enzymes : température, pH, milieu
  • Amélioration de la stabilité et DownStream Process

Gene shuffling : mutagenèse dirigée, évolution dirigée

Faciliter le remplacement, la délétion ou l’addition d’un ou plusieurs nucléotides dans une séquence d’ADN double brin.

  • Analyse de séquences : étude in silico relation structure/activité
  • Modélisation moléculaire : amélioration régiosélectivité
  • Génération de banques de mutants
  • Criblage d’activités enzymatiques / substrat
  • Caractérisation du substrat
  • Mutagenèse aléatoire
  • DNA shuffling

Incorporation d’acides aminés non naturels

Optimiser la reconnaissance de sucres et améliorer la stabilité des complexes : améliorer l’affinité et la spécificité des protéines par l’incorporation d’acides aminés non naturels (NAA).

  • Incorporation in vitro : par précouplage de l’ARNt ou par synthèse chimique
  • Incorporation in cellulo, via les ARNt synthétases cellulaires : méthode résidu spécifique et méthode site spécifique
  • Optimisation, développement de souches spécifiques

Caractérisation protéique et purification des protéines

Améliorer les procédés de purification afin de faciliter la caractérisation protéique,  évaluer et analyser la structure tridimensionnelle des protéines.

  • Evaluation de la pureté protéïque : électrophorèse, spectroscopie (Nanodrop), Bioanalyzer
  • Prédiction structurale
  • Filtrage des candidats : réactivité chimique, propriétés physicochimiques, docking, dynamique moléculaire et deep learning
  • Classement des molécules : drug design, modélisation d’interactions (ligands-protéines)

Fonctionnalisation de protéines et de biomolécules : solubilité, stabilité à la température et pH

Améliorer l’affinité moléculaire et mettre au point des marqueurs pour la détection ou la séparation de molécules biologiques d’intérêt.

  • Chimie click et ingénierie macromoléculaire
  • Bioconjugaison (biodétection, FRET, …)
  • Modification chimique/électrochimique de résidus in situ (Lys, Tyr, Cys)
  • Incorporation de fonctions chimiques activables
  • Modification des propriétés physicochimiques de biomolécules par voie enzymatique (ex : diminution de l’hydrophobicité ; acétylation/déacétylation ; fixation de macromolécules sur substrats polymères ; …)
  • Immobilisation ou marquage biologique

L’appui des laboratoires de recherche

Pour mener à bien vos projets d’innovation, nos équipes bénéficient de l’appui et des moyens techniques des laboratoires de l’Université de Nantes.

Ingénierie moléculaire et glycobiologie

Cyrille GRANDJEAN

Directeur de recherche au CNRS, C. Grandjean est spécialisé dans la thématique de recherche ‘Sucres et reconnaissance moléculaire’. Il est responsable scientifique au sein de CAPACITÉS.

C. Grandjean est co-inventeur d’un vaccin glycoconjugué actif contre la dysenterie bacillaire.

 

Brevets et publications

C. Grandjean compte 52 publications dans les journaux internationaux et est co-inventeur de 7 brevets.

En savoir plus

Développement de nouveaux outils enzymatiques

Charles TELLIER

Membre de l’UMR CNRS n° 6286 Fonctionnalité et Ingénierie des Protéines (UFIP). Professeur émérite de l’Université de Nantes et conseiller scientifique auprès de CAPACITÉS.

Unité Fonctionnalité et Ingénierie des Protéines (UFIP)

L’UFIP (UMR CNRS 6286) est un laboratoire en sciences biologiques qui mène des recherches fondamentales en biochimie (in-vitro, in-vivo et in-silico) et en épigénétique.

Equipe de recherche : Ingénierie Moléculaire et Glycobiologie

Les principaux champs disciplinaires de l’équipe sont : la glyco-enzymologie, la glycotechnologie de la reconnaissance : conception de lectines artificielles (dérivés de sucres) pour des applications en santé (diagnostic, anti-infectieux, anti-cancéreux), la glyco-technologie vaccinale.

 

Publications scientifiques de référence :

 

Développement de biocapteurs

Notre parc de moyens d’essai et de mesure

Plus de 150 équipements dédiés

Nous vous proposons des prestations à façon, mobilisant parfois plusieurs appareils, afin de répondre précisément à votre besoin.

Les défis relevés

CAPACITÉS développe une enzyme pour la biotech DNA Script

Nos experts en ingénierie enzymatique ont accompagné la biotech DNA Script pour faire évoluer une enzyme de synthèse d’ADN.

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Les enzymes au cœur de la thérapie cellulaire

L’acide hyaluronique est très présent dans la thérapie cellulaire. Comment désacétyler ce polymère pour obtenir des résultats encore plus performants ?

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Des laits maternisés plus nutritifs grâce aux enzymes

Un industriel spécialiste du développement des HMOs cherchait à mimer les structures de ces oligosaccharides pour les incorporer dans les laits maternisés. Elle a fait appel aux experts CAPACITÉS pour réaliser une synthèse enzymatique d’oligosaccharides.

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